18 октября 1991 года Азербайджан обрел свою независимость, но несмотря на это черные тучи не рассеивались над страной.

8 декабря 1991 года в резиденции «Вискули» близ города Брест руководители Беларуси, России и Украины подписали соглашение о создании Содружества Независимых Государств. Так называемое Беловежское соглашение положило конец существованию СССР как субъекта международного права.

Хотя Азербайджан не присоединился к этому соглашению, но, чтобы преодолевать внешние угрозы и обезвредить внутренние проимперские силы 29 декабря 1991 года было проведено всенародное голосование. Азербайджанский народ единогласно проголосовал за государственную независимость.

В Азербайджанской Республике, восстановившей свою государственную независимость волей народа, царила очень сложная ситуация, но несмотря на это государственные символы независимого Азербайджана были приняты.

Ускорился процесс признания независимости Азербайджанской Республики государствами мира. 2 марта 1992 года Азербайджанская Республика была принята в члены Организации Объединенных Наций. Еще раз город Баку закрепил за собой статус столицы.

Но, со времен Советского Союза независимый Азербайджан унаследовал Нагорно-Карабахскую проблему, возникшую в результате территориальных претензий Армении к Азербайджану. Армяне, сначала с помощью советских, а позже российских военных сил провели крупномасштабные военные действия в Нагорном Карабахе, заняли ряд стратегических позиций и изгнали азербайджанцев со своих земель. В сентябре 1991 года в Нагорном Карабахе была создана незаконная, марионеточная структура под названием «Нагорно-Карабахская Республика». В ответ на это 26 ноября 1991 года Верховный Совет Азербайджанской Республики принял закон «О ликвидации Нагорно-Карабахской автономной области Азербайджанской Республики».

9 октября 1991 года Верховный Совет Азербайджанской Республики принял закон «О национальных силах самообороны Азербайджана». Вместо того, чтобы образовать регулярную армию, в городах и районах создавались батальоны самообороны. Азербайджанские населенные пункты Нагорного Карабаха, одна за другой были оккупированы армянскими вооруженными силами. Все это с каждым днем обостряло ситуацию в Баку. В ночь с 25 на 26 февраля 1992 года совершилось одно из самых ужасных злодеяний XX века - Ходжалинский геноцид. После этого ситуация в Баку еще больше накалилась и вновь поднялась волна митингов. По требованию народа президент Аяз Муталибов был вынужден подать в отставку.

В мае 1992 года оккупация Шуши и Лачинского района еще больше усугубила ситуацию в Баку. Вновь произошла смена власти. Пришедший к власти Народный Фронт Азербайджана не смог предотвратить царившую в стране анархию. Пользуясь случаем, армянская армия 3 апреля 1993 года оккупировала Кельбаджарский район. 

Мятеж, поднявшийся в июне 1993 года в Гяндже еще больше усугубил ситуацию. 709-ая воинская часть при поддержке сторонников бывшего командира корпуса Сурета Гусейнова вышла из подчинения Министерства обороны. 4 июня для подавления военного мятежа правительство ввело войска в Гянджу и пролилась братская кровь. Правительственные войска потерпели поражение. Мятежники с требованиями отставки президента и правительства начали наступление на столицу. На всем своем пути они практически не встречали сопротивления. 14 июня недалеко от Навахи армии стояли лицом к лицу. У поселка Локбатан и на 75–м километре Шемахинской дороги в результате переговоров их удалось остановить. В связи со сложившейся ситуацией председатель парламента, премьер-министр и главы трех силовых министерств вынуждены были уйти в отставку.

При подстрекательстве внешних сил, в стране начался новый этап процесса раскола и сепаратизма. В это время полковник Аликрам Гумбатов задумал взять власть в свои руки и создать в южном регионе так называемую «Талыш-Муганскую республику». Вооруженные бандиты сепаратистской организации «Садвал» задались утопической идеей создания «Государства Лезгистан» и совершали диверсии на северо-востоке страны.

Власть, осознав, что не в силах предотвратить начавшиеся опасные процессы, в последний момент обратилась за помощью к председателю Верховного Меджлиса Нахчывана Гейдару Алиеву. Приняв настойчивые приглашения народа и правящих кругов республики 9 июня, он прибыл в Баку. Гейдар Алиев предпринял серьезные меры, чтобы остановить гражданскую войну в Азербайджане. 15 июня Гейдар Алиев был избран председателем Верховного Совета Азербайджана. Таким образом, этот день вошел в историю страны как День национального спасения. 3 октября 1993 года азербайджанский народ на альтернативной основе с подавляющим большинством голосов избрал Гейдара Алиева Президентом Азербайджанской Республики. Таким образом, начался новый этап государственного строительства.

«Контракт века», подписанный с авторитетными нефтяными компаниями мира, объединившимися в консорциум в сентябре 1994 года, открыл путь крупным капиталовложениям в Азербайджан и участию нашей республики в других глобальных, международных проектах. 

Но, обеспечение общественно-политической стабильности и успешные шаги, предпринятые на пути государственного строительства, в то же время привели в движение определенные внутренние силы, не отказывающихся от своих ничтожных политических претензий и рассчитывающих на своих зарубежных заступников.  Эти силы, являющиеся врагами национальных интересов Азербайджана, не гнушаясь открыто выступить против нашей государственности, в октябре 1994 и в марте 1995 годов с участием незаконных вооруженных отрядов, совершили попытки государственного переворота. Однако крах попытки переворота показало, что Азербайджанское государство опирается на поддержку подавляющего большинства народа.

12 ноября 1995 года в независимой Азербайджанской Республике состоялись первые парламентские выборы. В тот же день путем референдума была принята первая Конституция независимого Азербайджана.

Постепенно Азербайджан вступил на путь динамичного развития. Тревожные и беспокойные 1991-1995 годы Баку остались позади. В городе начались работы по созиданию и благоустройству. Облик города постепенно обновился и похорошел. Сегодня Баку сравнивают с развитыми и красивыми городами мира.